Tính đến nay, Viện đã chọn tạo và được công nhận đưa vào sinh sản 140 giống lúa, trong đó 63 giống được công nhận chính thức, 77 giống được xác nhận sản xuất thử

Cùng với việc chọn tạo và chuyển giao các giống lúa mới vào sinh sản, Viện cũng đã nghiên cứu, chuyển giao các quy trình công nghệ và các giải pháp kỹ thuật canh tác cây trồng theo hướng bền vững, tăng năng suất, chất lượng và nâng cao hiệu quả sinh sản… Để đấu phát huy những thành tựu đã đạt được và đáp ứng yêu cầu phát triển mới, Viện lúa ĐBSCL đang đặt đích phấn đấu trở thành trọng điểm nghiên cứu lúa có trình độ tiền tiến trong khu vực, đủ năng lực giải quyết những vấn đề lớn đặt ra trong phát triển nông nghiệp của vùng và của cả nước.
Từ khi thành lập đến nay, Viện lúa ĐBSCL đã chủ trì và tham dự thực hiện nhiều nhiệm vụ khoa học và công nghệ quan trọng, góp phần giải quyết các vấn đề KHCN trong lĩnh vực nông nghiệp của vùng ĐBSCL nói riêng và của cả nước nói chung, nhất là trong lĩnh vực phát triển sinh sản lúa gạo.
Với định hướng đó, Viện lúa ĐBSCL rất mong được các cấp, ngành Bộ, Trung ương quan hoài tương trợ trong việc đầu tư nâng cấp cơ sở hạ tầng kỹ thuật; hỗ trợ xây dựng Trung tâm Công nghệ để phục vụ nghiên cứu và vận dụng tốt công nghệ sinh vật học trong nông nghiệp cho vùng ĐBSCL; có các cơ thế chính sách đặc thù về lương, tăng thu nhập cho các nhà khoa học… đồng thời đó, cần tăng cường đầu tư kinh phí cho các đề tài, dự án nghiên cứu KHCN tại ĐBSCL vì đây là vùng trung tâm nông nghiệp cả nước nhưng đầu tư của quốc gia cho nghiên cứu KHCN nông nghiệp vùng này chỉ chiếm tỉ lệ khoảng 10% so với cả nước.
Mặt khác, hiện Nghị định 115/2005/NĐ-CP về KHCN đến nay khai triển còn có một số vướng mắc bởi luật Ngân sách, luật cần lao, luật Công chức… rất cần được tháo gỡ ngay. Phát biểu tại buổi làm việc, Nguyên Phó Chủ tịch nước Nguyễn Thị Bình đã đánh giá cao những thành quả đạt được của Viện lúa ĐBSCL trong thời kì qua cũng như định hướng hoạt động thời kì tới, đồng thời cho biết Quỹ Hòa bình và Phát triển Việt Nam sẽ ghi nhận và tụ tập các quan điểm và kiến nghị để đề xuất lên các cấp chính quyền và bộ ngành ở Trung ương coi xét, quyết định.
Hiện trong tổng số khoảng 6,88 triệu ha gieo trồng lúa của cả nước thì diện tích dùng giống lúa do Viện lúa ĐBSCL chọn tạo đạt trên 3,5 triệu ha, chiếm tỉ lệ trên 50%. Minh Luân.